原生物種（英語：native species、indigenous species），又稱本土物種。在生物學中，若一物種被認為是「原生物種」，表示其在該地的分布純粹是自然因素造成的，沒有人為因素夾雜其中。每種野生生物都有一定的自然分布範圍，在該範圍內，該生物被視為是原生物種。物種有可能因人類活動而散布到原生範圍之外，在這些區域該物種就會被視為外來物種。

原生物種不一定是特有種，在生物學及生態學中，特有種是指分布僅侷限於某一地區的某物種，而原生物種則可能在分布於某區域的同時，亦分布於另一區域。原生物種及特有種的觀念都不表示該物種一定起源或演化自該區域。

入侵物種（Invasive species）是引進物種的一個子集。如果一個物種被人為引入一個其先前不曾自然存在過的地區，並具備了在無更多人為干預的情況下在當地發展成一定數量的能力，以至威脅到了當地生物的多樣性成為當地公害，就可稱之為「入侵物種」。