有男女兩種選擇，之後便是設定名字，輸入完畢後，會介紹本作的兩位勁敵，貝魯（女）和切雷恩（男）。 之後便正式進入遊戲。一開始主角在房間裡，兩位勁敵會走進來。 之後會和主角說起關於博士送的禮物的事。 禮物上的信寫著，從三隻PM中選擇一隻！ 之後打開禮物。這裡筆者選擇了火豬。

隨後兩位勁敵也選擇了PM，好戰的貝魯主動要求與主角對戰。 她使用的是被主角選擇的初始PM克制的那隻（Lv5)。
無論戰鬥勝負（勝利就得到500，敗北的話。。呵呵。。），因為精靈對戰，房間裡亂得不成樣子（。。。）。 然後切雷恩幫助主角和貝魯的PM回复HP。

之後與切雷恩對戰，他使用的PM是克制主角選擇的初始PM的那隻（Lv5)。戰鬥後（勝利得到500）因為媽媽的呼喊，兩位勁敵下樓，跟著下樓吧。

原來樓下的媽媽聽到了精靈對戰的聲音，便喊三人下來，之後三人才想起去研究所的事情。 兩位勁敵走後，媽媽會幫主角的精靈回復體力。之後得到視頻功能！ 然後離開自己家。從自己家出來後看到貝魯急匆匆的離開。 去貝魯的家（左邊），一進去就看到貝魯對自己父親表示要成為偉大的精靈訓練師。 之後貝魯往外走的時候看到了主角，說了“沒關係的，沒關係”，便離開了。 （小光你跑錯世代了。。）

之後往博士的研究所（最上面）進發，看到門口立著的兩位勁敵，和切雷恩說話，一起進去見博士。進去後博士向三人打招呼，正要自我介紹的時候，切雷恩卻說出了她的名字，博士大囧。 。 之後她重新介紹了自己，是為了研究精靈誕生和起源的博士。隨後，她說PM是值得信賴的一起戰鬥的伙伴，並且問你要不要給初始PM取名字。 （這裡隨意）

不管你說什麼名字，她都會說是個好名字的。 。 。

接著她說到了PM圖鑑，對此貝魯表示疑惑不解，博士做出了解釋。 PM圖鑑是能自動記錄遇到的PM資料的道具。 主角等三人要為了精靈圖鑑的完成而踏上冒險之旅。 這裡選否的話會無限問你。 。 老實選是吧。
　

在此之後，博士會說要教大家遭遇野生PM的方法，要大家來1號道路等她，之後離開了研究所。 兩位勁敵為之後如何冒險議論紛紛。離開博士的研究所，兩位勁敵也會一起出來。 主角的媽媽正在門口等著主角，她會讚賞主角接受了博士完成PM圖鑑的願望。 （我是被迫的。。TAT)把小鎮地圖給了主角等3人。
　

之後媽媽鼓勵主角在伊修地方盡情地冒險，便離開了。 兩位勁敵也去1號道路找博士了。
往右，再往上去鎮子，和兩位勁敵一起去1號道路吧！博士會在那等著，告訴眾人PM圖鑑會自動記錄遇到的PM，如果能捕獲PM能得到更詳細的信息。 之後便是一場演示的捕捉精靈的過程。隨後主角得到5個精靈球，博士離開。 兩位勁敵發下了競爭宣言後也跟著離開了。

之後往上走，到下一個城市前面。 兩位勁敵就在那等著你，問你抓住了多少PM。 不過，數目並不影響什麼劇情。 （就算抓一隻也可以）然後博士用視頻功能叫大家去精靈中心。進入下一個城市，到精靈中心門口（出鎮的路被2個怪人攔住了），發現兩位勁敵正等著你。 進去後博士在裡面，會介紹精靈中心的功能，之後和上面的喬伊小姐說話恢復PM的HP.
然後是介紹左邊的儲存PM的電腦，以及右下的道具店（道具店和精靈中心合體了。。）

整備完畢後，出門往左，和切雷恩對話，會發現左邊有個老怪人在一群怪人（。。）的簇擁下來發表演講。 那個老怪人自稱是等離子團的，說了一堆關於如何對待PM的話，之後就走了。主角和勁敵才不會被他洗腦呢，但是這時候就跑過來一個被洗腦的人，他的名字叫N。 他會說PM根本不需要精靈球來束縛行動，和主角展開對戰。使用PM為Lv7的No.015.打敗他後他很失望地離開了。 從左邊離開鎮子吧。

出鎮收到媽媽的視頻來電，之後媽媽出現在自己身後（好快。。）給了你跑鞋，按住B可以跑得更快，在室內也有效。
這裡開始會出現訓練家，被他們視線看到會強制展開PM對戰。到下一個鎮子，門口看見貝魯，她會要求和主角對戰，使用PM為Lv7的No.12和Lv.8的被克制的主角PM。

（打第一道館時可先去夢之遺跡一直往又走看到第3人會給你一隻NO.17.19.21。【感謝網友：林鈺傑／補充】
到道館（精靈中心右邊）會看見門被擋住了，先去當地的精靈學院（精靈中心左邊）吧。和切雷恩（最裡面的）對話完畢，會要求和主角對戰。 使用PM為Lv8的No.15和Lv.8的被克制的主角PM。接著在右邊的道館，與門口的館主對話後他會進去。 進入道館後可以得到一個恢復50HP的蘇打水。 注意踩的地板順序，為火（紅色，克草）和草（綠色，克水)和水（藍色，克火）。 本作館主前的的普通訓練師都很強，小心對付。

到最深處和館主對話，會分出3個人。 。 和最前面那個人（使用PM屬性克制你的初始PM對話）。 。 開戰！使用PM為Lv12的No.12，和Lv.14的克制你初始PM的猴子（No.17,19,21中的一隻)。 建議鍛煉自己的初始PM等進化了再對戰。 （火豬Lv17進化。。）
　

戰勝他後得到徽章！ 可以控制交換得到的Lv20以下的PM.得到83號技能機器！ 效果攻擊特攻都上升一級。 （雙刀用強化技能？另外本作的技能機器都可以無限使用。)出門後見到一位女研究員，被她帶進右邊的房子。 原來她是博士大學時的朋友，得到秘傳機器01。 可以砍伐掉路上的小樹木了。

往右出門，可以到達一個叫夢之跡地的地方。 進入後不久一處破牆邊的樹木可以砍伐掉。 之後貝魯出現，問你是否來找不可思議的PM，就進去了。進入那里後聽到PM的叫聲，趕快過去看看。 會看到一隻PM（No.23)，之後跟著它跑的時候，等離子團的嘍囉出現（衣服好沒品。。），想抓它，依靠它進化後放出的瓦斯催眠人們來操縱人心，實現“使所有PM自由”的目的。 一言不合，開打！
　

2連戰，使用PM為Lv.10的No.10，以及Lv.10的No.15。 戰勝他們後，他們還嘗試抓捕，這時候等離子團的頭目出現（分身了！？），兩個嘍囉怕被處罰逃走了。 之後頭目也消失了。然後那隻PM的親人來找它，女研究員也趕來，它們丟下一樣道具離開了。 女研究員撿起那個道具，要主角來她的家。 跟著過去吧。

在那兒可以獲得C-GEAR。 （終於有電子表功能了。。）點畫面右下的電源鍵可以啟動它。 （是一種通信功能）之後旁邊的女孩會給你WI-FI好友本。夢之跡地的道路暫時無法繼續前進，從左邊出鎮子去3號道路吧。 跑不久就會發現飼育屋，可以寄放PM使它們自己升級，更可以培育出PM的蛋。

往左走，切雷恩會攔住你。 對戰！ 使用PM為Lv.14的克制你的主角PM和Lv.12的No.15。打敗他後2個等離子團的嘍囉急匆匆逃過，發生了什麼事？ 之後貝魯和一個孩子跑過來，原來孩子的PM被等離子團的抓走了。 切雷恩表示要去追回孩子的PM之後往前去了。

往前走，會看到一個洞穴，切雷恩在門口。 他說看來那2個嘍囉跑進洞穴中了。 PM準備完畢後（選是），追上去！在地下水脈洞穴，進去就能看到切雷恩和2個等離子團的嘍囉。 他們還大放厥詞說小孩子不適合用PM，開戰！ 使用PM為Lv.12的No.10。打敗嘍囉後，切雷恩要求把孩子的PM還回來。 這時候突然傳來“沒有還的必要!!”的吼聲，原來又來了2個等離子團的嘍囉。

雙打對戰！ 切雷恩會幫你的忙，他使用的PM是前一戰的PM。 等離子團使用2只Lv.12的No.10.打敗他們後就會把孩子的PM歸還。之後跟著切雷恩出洞，去前面和他對戰的那裡。 貝魯和孩子表示感謝，同時孩子送你一個治療球。 往下前進遇到切雷恩，他會告訴你顏色很濃的草里會同時出現2只PM，要注意。 往下左前進去下一座城市吧。
　

在下一座城市進去後就會碰到切雷恩。 他會帶你到精靈中心，告訴你館主使用的是普通系PM用格鬥系PM會比較有利，並且給你醒睡果。往上走到博物館門口，遇到N，他依然固執地想要宣傳自己的思想。 對話後選是再次開戰！ 使用PM為Lv.13的No.57,No.41,No.38。 打敗他後他會離開，並且說出他的目標是伊修地方傳說中的PM，賽克羅姆（黑版）/雷吉拉姆（白版）

進入博物館看到一個人正看著一座巨大的快龍的骸骨化石。 那人表示自己是這座博物館的副館長。然後他會給你看化石蠍的化石，一塊隕石，和沙漠附近發現的石頭。 最後他會帶你到一個門前說這是道館。 進去挑戰吧！ 一進去還是會得到一瓶蘇打水。

 
這個道館內要翻閱書本來找到館主。 順序是左下櫃子椅子上面那一本→左中櫃子椅子上面那一本→左上櫃子上那個女研究員（對話選是，開戰）（居然是機關車。。）→右下櫃子椅子上面那一本→右中櫃子椅子上面那個女生（會開戰）→之後櫃子移開現出密道，進入後和館主開戰！使用PM為Lv.18的No.13,Lv.20的No.11。 打敗她後獲得徽章，之後突然聽見“媽媽——！！”副館長跑進來了。 （原來是母子關係。。）原來是等離子團前來入侵，一起出去會會他們吧。

 
出門後發現等離子團的一群人把快龍骸骨的頭部搶走了，追上去！ 出去看到館主的同時會同時看到另外一個道館的館主，兩位勁敵也會趕到。從貝魯手裡得到道具探索器！ 之後勁敵們負責守護博物館，2位館主各自分頭離開。 往左邊走遇到另一位館主，看來等離子團逃進了森林中。 有2條道路，館主負責上面的道路，主角就往左邊進發吧！
路上會遇到幾個嘍囉，打敗它們！ （怎麼本作的精靈護林員變忍者了。。喜歡躲在綠色泥丸裡，打敗三個用三種屬性猴子的人後能得到3種果實 ）

打敗第四個嘍囉後奪回快龍的頭骨，然後等離子團的一個被稱為七賢者之一的干部出現接走那嘍囉，想要為他報仇，兩位館主的出現使他放棄了這個想法而丟下威脅的話離去。臨走前，普通系館主會送給你一個月之石。 從右邊再往上出去吧。 穿過一座雄偉的大橋（景觀確實是歷代最雄偉的。。）能到達新的城鎮。

往最左邊再往上（這個視點可能有人不熟悉。。）到道館門前，切雷恩會從裡面跑出來，說了一句話急匆匆離開。 前面出現的那位蟲系館主也會從裡面出來離開。 跟過去。 從圖示地點往下。之後會遇到貝魯，蟲系館主和一位神秘少女愛莉絲（黑白動畫女主角？暫不劇透）談話間一個等離子團嘍囉出現了。 看到大家在對話就逃走了。 。之後蟲系館主離開，跟著他過去道館的方向吧！

在靠左邊的街上（不是道館裡）看到3個等離子團嘍囉和蟲系館主對峙。 選是和一個嘍囉對戰。 戰翻這些雜魚吧！ 打敗他們後他們會跑去向七賢者報告，然後愛莉絲和貝魯趕到。 跟著他們進去吧！進去看到3個等離子團的七賢者，原來他們的野心是要成為“解放”伊脩大陸的英雄，所以四處演說。 之後他們把No.23還給了貝魯，便離開了。

其他三人也跟著離開，蟲館主說在道館裡等著主角。 去道館會會他吧！蜂房一般的道館的解謎方式是對於黃色粘液狀的門，推左邊→推右邊→推中間！ 就可以過去了。其實按下所有按鈕就可以到館主那了，但是要注意左下的那個按鈕和中→右上那個門後面的按鈕是個陷阱，裡面是訓練師，不想打請別按。 那個按鈕上面一個按鈕還是要按的。

出道館後收到貝魯的視頻通信，會在4號道路等著和主角對戰。 往上面出鎮子赴約吧。 （話說那條人們跑來跑去的街異常喜感。。）她使用的PM是Lv.18的No.13,Lv.18的No.23,Lv.20的初始PM第一進化形態（被你的初始PM克制），Lv.18的猴子（克制你的初始PM）

打敗她後她就會往下離開了。 從4號道路往上遇到切雷恩，對戰吧！ ！ 記得前面恢復好他使用的PM是Lv.20的No.25 Lv.22的初始PM第一進化形態（克制你的初始PM）， Lv.20的猴子（和你的初始PM同一屬性）,Lv. 20的No.16（注意沙暴天氣）
打敗他後接到博士來電，之後切雷恩離開。 往上的時候注意對戰的時候會出現沙暴天氣。 上面的No.57鱷魚是不錯的PM，建議捕捉培養。往最上面走，到建築物裡面會看到博士和切雷恩。 得到超級球。 之後兩人離開，前進吧。

一進去新城市就有不平事，兩個等離子團的嘍囉在欺負飼育屋的老爺爺，要搶走他的PM！ 爺爺找主角幫忙，這時候當然要見義勇為，幹掉這些煩人的嘍囉！打敗一個嘍囉後他們會逃去遊樂場。 從老爺爺手裡得到自行車！ ！ 哦終於不用按著B狂跑了。 之後老爺爺離開。 貝魯出現，邀請主角去遊樂場後離開。 往上跟著去遊樂園與貝魯對話後進入。進入後從一個老人手裡得到裝飾箱，可以裝飾你自己的PM。 之後貝魯和老人分別離開。

 
出門看見貝魯和自己的父親在對話爭論關於旅行，這時候一個金發雙馬尾（是我喜歡的類型哦也！）跑了過來，原來她是這裡的館主。 她睡服（？）了貝魯的爸爸支持女兒繼續精靈訓練師之路，之後幾人離開。往城市的右中進一個門，N在那裡等著你。 他會告訴你等離子團的行踪。 跟著過去一起乘坐摩天輪吧！ （私奔？）原來他就是等離子團之王（好弱。。）

 
出來後會看到幾個等離子團的團員，為了保護他們，N會與你對戰。 使用的是Lv.22的No.57，No.67,No.65,No.60。 打敗他後對話會出現他的特寫（抗議！）。 隨後他會離去。往左邊走來到道館，挑戰吧。 這是個乘坐遊園車的高科技道館，一路乘纜車同時按下按鈕前進便可到達最深處。 然後與館主戰吧！ （這館主真像鏡音鈴。。）

使用的PM為Lv.25的No.93兩隻，Lv27的No.29。 打敗後得到徽章和技能72，可以控制Lv50以下的交換得到PM。 接著從城市左上出去（右上路不通）。出去後遇到切雷恩。 又要對戰。 。 我說你妹的可不可以不要整天纏著老子啊！Lv.24的猴子（和你的初始PM同一屬性），Lv.24的No.25，Lv.24的No.18，Lv.26的初始PM第一進化形態（克制你的初始PM ）。
　

兩人分頭離開，從橋上通過吧！ （沒前面的長。）繼續往左邊走，經過一座短橋看到了切雷恩和一個大叔。 原來那個大叔就是這裡的道館館主。 此刻他正在追捕進入城市的等離子團。 之後兩人離開。往左下的冷藏庫走，往左走到裡面切雷恩會追上你，從冷凍庫左邊的小門進去吧。 （不是正門！真猥瑣）

 
進去居然又是冰天地。 。 通過滑行來到達要到的地方。 滑冰什麼的最討厭了。 。 到達圖示的最深處，切雷恩會追上來，冷凍庫的箱子裡面有個門，從那裡一起進去吧。進入發現等離子團的嘍囉們和七賢者之一，他們打算搞群毆！ 而主角的任務是解決一半的敵人，戰吧！ 搞定右邊4個姨媽（無誤）後，館主帶著一群城管趕到，於是等離子團的團員都被帶走了。 （喂喂老頭你也太不給力了吧！好歹是個七賢者）館主離開前說會在道館等著主角。

 
出去冷凍庫後到城鎮右上角的道館，發現一群等離子團的團員以及兩名七賢者堵住住了館主。 並且又宣揚什麼“讓精靈解放”之類的。 然後他們自個離開了。之後切雷恩趕到說了一段話就離開了，進入道館吧！ 這裡要使用電梯前進。 順序是下-右邊那個平台-下-前面那個平台往上走過一段遠路到達一個新的平台-下-三個平台，選上面那個，上-右邊的平台，下。 到達館主房間！

館主使用Lv.29的No.58,Lv.29的No.42，Lv.31的No.36。 戰勝後得到徽章可以控制60以上的交換得到的PM，之後館主說會到6號道路的洞穴前等著你。出門往左邊走，貝魯會從後面追上來對你挑戰。 她使用的PM是Lv.26的No.13,Lv.26的No.24,Lv.28的初始PM第一進化形態（被你的初始PM克制），Lv.26的猴子（克制你的初始PM）打敗她後拿到秘籍02飛空術！ 終於不用辛苦跑腿了。

繼續前進，途中的研究所要你把四季鹿給你看，作用暫時不明。 路上可能有些道具是No.96偽裝的，往左上走到一個電氣洞穴，調查黃色蜘蛛網（？）前面的館主會出現，用No.58的碎岩術打破畫著黃色蜘蛛網的石門。 得到No.78技能機隨後館主離開。 進去後看見N，走過去會被2個突然瞬間移動出現的怪人（白井黑子淚流滿面。。）抓到了N面前，然後2個怪人瞬移消失。
　

和N對話後選是，N離開。 往裡面觸碰擋路的水晶遇到貝魯，和隨後趕來的博士。 從博士手裡得到幸運蛋！ PM帶著會增加力。可以把擋路的小水晶推向帶電的大水晶以前進，有時候路上會出現沙子揚起，可以遇到野生的No.35或者拿到道具。 開路後博士通過研究明白了這裡100年前曾經有傳說中的精靈存在。
　

往下走，又碰到3個瞬間移動男把你帶過橋，結果發現路被堵住了，叫你往下走。 繼續前進，在下樓梯後往上直走會碰到一條有等離子團團員把守的通道，一直打敗嘍囉前進吧。 最後的地區請往右打敗嘍囉上樓。上樓後往左走，會看見N。 與N對戰吧！ 他使用的PM是Lv.28的No.11，Lv.28的No.105，Lv.28的No.101,Lv.28的No.103。

戰勝他後博士和貝魯趕到，博士和N辯論後N和兩人紛紛離開。 從右邊離開去新的城鎮吧。在新城鎮，往上走遇到博士和當地的館主，會給你的PM圖鑑升級，以後公母PM的外貌區別也可以記錄了，還增加了檢索機能。自後兩人離開，館主要你去7號路。 （記得買個挖洞繩）往右上到7號道路，注意有時候草叢會晃動，能遇到野生的No.37。 這裡前進的方式是走細桿，小心不要掉下去。 往最上走進那座塔里。

最頂層看見館主看著一個鐘，對話後一定要記得點那個鐘！ ！ 點確定搖響它，之後館主會回去。 然後飛回城，往左邊有飛機跑道的地方，最上面就是道館了。道館的前進方式是人間大砲（。。。）請注意從不同的方向進入發射的方向也不同。
令人頭暈的發射人間大砲（中間還撞牆上了。。）後到達館主那，館主使用PM為Lv.33的No.34，Lv.35的No.87，Lv.33的No. 27。 戰勝後可以獲得第六枚徽章，可以控制70級以下的PM，同時得到技能機器62。

出門碰到N，他還是老樣子，訴說一番自己的所求後走了。 往7號道路的右邊走，往上可以到一座山。 正要過去，切雷恩趕到，與你展開對戰。使用Lv.33的No.27，Lv.33的猴子進化（和你開始選的PM屬性一樣)Lv.35的初始PM第一進化形態（克制你的初始PM）Lv.33的No. 18。打敗他後發現冠軍出現在山洞門口，跳下來對話後得到秘傳03衝浪術。 進入山洞後遇到切雷恩和第五館主，對話後2人離開，在山洞中探索吧。

在某個地方會看到切雷恩和等離子團團員戰鬥，之後等離子團另一個人到來，兩人離開。 切雷恩說他們是被迷惑了的人。 從右邊出去，碰到博士，他要你去龍之塔。 往上面走，恢復體力後先進入冰系道館吧。這裡又是老樣子，通過滑冰前往想要到的地方，在倉庫裡已經見識過了吧。 注意碰到拐角會滑往旁邊，按按鈕就可以調整拐角的方向。滑冰到最裡面，和館主戰鬥吧！ 他使用的PM是Lv.37的No.89，Lv.39的No.120，Lv.37的No.121。
　

到龍之塔門口看到博士，貝魯也追了過來。 原來等離子團中出了龍之塔。 。 。 錯了，是鑿開塔壁入侵了龍之塔。 龍之塔最上面有眾人追求的傳說中的PM，因此N才要上去獲得它吧！ 從博士手裡得到森之羊羹，就上塔去吧。往塔上前進，到一個樓梯口就會震動，塔的最上層發生了什麼事！ ？ 一路往上發現切雷恩，原來通道倒了一部分。 繞遠路到他那去吧！注意石柱是可以上去的！ 不要亂轉浪費時間。 。

 
在4L發現切雷恩和冰系館主擋住了一群等離子團的成員，趁這個時候擊敗下面的大批嘍囉，從下面前進吧！6F請從右邊開始繞圈子，順序是右前右前左上右下左下右下左。7F聽到PM的吼叫聲，然後往上，會看見一個七賢者和4個雜魚，雜魚們會圍住你群毆。 有點小麻煩，4個人加起來有6只PM，戰翻他們吧。 之後往上走，看到N站在塞庫洛姆（黑版）/雷吉拉姆（白版）面前。 他向神獸述說自己的慾望，要征服精靈聯盟，看來已經來晚了。 。 N打算去尋找另外一隻神獸，塞庫洛姆（白版）/雷吉拉姆（黑版）。 然後被那隻神獸帶走了。

切雷恩和冰系館主趕到，切雷恩看到他能馴服傳說中的PM，懷疑N是不是真的救世主。出來後五人正在交談，說到還有一隻傳說中的龍之PM，冠軍趕到。交談後大家決定去4號路的古代之城找另外一隻傳說中的龍之PM。 飛回正下方那座城市（蟲系道館的所在地）。 往上去4號道路，在沙漠的最後往左走。 到達一片新的沙漠，往左上走，會看見不少PM雕像，那裡有個往下的樓梯，正要下去的時候會遇到切雷恩，從這裡進入古代之城吧。

往左走，第一個入口的流沙右下有個朝左邊的人，和他說話他會因為身上化石太重給你一塊化石。 之後提示你第二個道館那可以復原化石。第二層開始果然見到了等離子團的嘍囉！ 這時候當然是戰翻他們。 一路下落，前進，反正挑有人的地方打就是了。到最深處見到冠軍和等離子團的七賢者之一，切雷恩也來了。 話不投機，眾人分頭離開。

（冠軍說的很對，用種族685的一級神就算攻破了聯盟又有什麼值得自豪的？）之後收到博士的通信，要你去第二座道館那的博物館。 眾人分頭離開。 飛去第二座道館吧。在博物館前見到大家，館主也出來了。 選是同意為了和平和N戰鬥！ 獲得光明之石（黑版）暗黑之石（白版）。 （任務道具）

接著冠軍去通知第八個道館的館主了。 眾人也分頭離開。 飛去第七個道館的城市，往右邊去8號道路。 一直往右，到達一座建築前，這時候貝魯會趕來，和你進行一次對戰。她使用的PM為Lv.38的No.14,Lv.38的No.24,Lv.40的初始PM第二進化形態（被你的初始PM克制），Lv.38的猴子（克制你的初始PM)

戰勝之後勁敵送你一個藥就走了。 往建築物內進發，過鐵道橋的時候，三個瞬移男又出現包圍住你，把你帶去和七賢者之一對話，然後幾人紛紛離開。過橋到9號道路，得到56號技能機。 通過9號道路，到達最後一個道館所在的城鎮！ 進去碰到冠軍，他會帶你去七賢者演講的地方。 他又在說什麼N是被傳說中的龍所認定的救世建國的英雄，以及解放PM說。

接著愛麗絲和一位老人趕到，跟著愛麗絲一起走吧。 在屋子裡可以了解傳說中的兩隻PM的情報。 樓上的NPC可以給你一個道具，PM攜帶減輕一半重量。城市左上方就是最後一個道館。 前往挑戰吧！ 用冰系技能可以很好的克制龍系精靈。 這座道館的訓練師很多。 。 館主就是前面見到的老人（黑版）/愛麗絲（白版）。
　

使用Lv.41的No.117，Lv.41的No.127，Lv.43的No.118。 擊敗後得到最後一枚徽章，可以操縱所有等級的PM，同時得到技能機器82。出去看到博士，她會把你帶去10號道路的路口，先去挑戰精靈聯盟吧！

是否後悔與精靈一起去旅行？ 選否！ 得到掌門球（大師球）。進去櫃檯處會告訴你7號道路出現了暴風雨。 進入10號道路後一直往右，兩位勁敵又來了，切雷恩提出和主角對戰試試實力。 使用PM為使用Lv.43的No.27，Lv.43的猴子進化（和你開始選的PM屬性一樣)Lv.45的初始PM第二進化形態（克制你的初始PM）（帶了剩飯。。）Lv.43的No.18。戰勝後他會幫你的PM恢復。 之後貝魯給你一個元氣塊，兩人離開。 往右走，打開8道代表8個徽章的大門，進入冠軍之路吧！ ！
　

路上看到一個不敢滑下去的人。 。 膽小鬼。 你可以從那裡下面試試滑下去。七彎八拐通過了冠軍之路（石頭先不要去理。），來到宏偉的精靈聯盟前，前面的接待人表示，只有不間斷地打到四天王和冠軍，才能表現出訓練師的強悍！打倒四天王！ 四天王使用的PM大多數都是Lv.48。 （從門的從左到右算）

 
第一個天王使用鬼系PM，分別是No.69,No.99,No.115,No.129(Lv50)。
第二個天王使用惡系PM，分別是No.59,No.16,No.66,No.131(Lv50)。
第三個天王使用超能力系PM，分別是No.85,No.24,No.67,No.82（Lv50)。
第四個天王使用格鬥系PM。 分別是No.44,No.45,No.40,No.126（Lv50）。
結束後回到正中間和雕像對話，下去。

 
最裡面等著主角的是N和冠軍。 見到主角到來，他召喚出了等離子團的城堡！ ！無數巨大的建築物突然拔地而起，把梯子伸向了精靈聯盟。 之後他從梯子上離去，切雷恩趕到。 從左邊的梯子前往等離子團的城堡吧！ ！

 
進去後6位賢者在那等著你，講出6句名言，準備和主角開打。 但是8雙阿迪王。 。 錯了，8位館主趕到，攔住了6位賢者。 從左邊離開，在等離子團的城堡裡探索吧！

 
裡面一個瞬移三人組之一會出現指給你一個可以恢復精靈HP的房間。 進去和左邊粉發的女孩對話可以恢復PM。
不斷從最右邊/左邊的階段前進，會出移那2次瞬移三人組，第三層最後一個會指給你N“希望的世界”。 進去看到一個兒童的房間。 。 原來這就是N希望的世界。

在最上一層的門前，最後一名賢者出現，進入那個門，接受N的挑戰吧！ ！ N會召出塞庫洛姆（黑版）/雷吉拉姆（白版）。 而主角手中的光明石（黑版）黑暗石（白版）也會發光，塞庫洛姆（白版）/雷吉拉姆（黑版）出現！ N要求主角證明自己的實力。 誰才是真正的英雄。 。 就在這裡證明給你看！ ！

與神獸對話開戰，Lv50。 捕獲它吧！接著和N展開決戰！ 使用PM是Lv.52的塞庫洛姆（黑版）/雷吉拉姆（白版）（No.149/150)，Lv.50的No.077（佐羅亞克），No.107, No.090,No.073,No.071。

神奇世界-神奇寶貝